“信号塔大战”后，熊大、熊二和光头强的缩小器再度遗失。三人组合继续留守不夜城，找寻缩小器的回家之路更是状况频出，但他们从未放弃希望，最终与小动物们合力拯救小镇，呈现了一场精彩惊险的微观世界冒险之旅。
该作讲述的是与钢管舞相遇后改变人生的少女们努力和成长的青春故事。
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大灰（JB·布兰科 JB Blanc 配音）是一只狼，英俊自负，梦想当上狼群的统领。老吉是大灰的强劲对手，与大灰竞争狼王的位置，他们决定比武一决胜负。就在比武的前夜，大灰不小心中了魔法，变身成一只羊。他不得不离开狼群，与羊群居住在一起。老吉趁老狼王不备，将其推下山崖夺得狼王之位。一只小羊偷跑到北方草场被狼群捉住，大灰将其救出。这个行为激怒了老吉，他决定袭击羊群。得知狼群要袭击羊群的时候，大灰决定领导羊群与狼群抗争。在建设防线的时候，大灰被发现与狼群有瓜葛，失去了大家对他的信任。他不得不独自离开羊群，在路上他的到一个接触魔法变回狼的机会，但是同时得知狼群马上就要袭击羊群，他放弃变回狼的机会，毅然回到羊群，带领羊群战胜了狼群。两个族群最后达成了和平协议。
影片讲述了七只皇家御蛋被弑天法师掳走，意外落入年轻的实习造型师阿泰手中，被迫成为“护蛋使者”的阿泰由此与萌娃们共同踏上充满挑战的归家之路的故事。
弗兰克（比尔·默瑞 Bill Murray 饰）是一个普通的动物园管理人，某一天，他误食了一枚被猴子啃过的苹果，一种名叫瑞克斯（劳伦斯·菲什伯恩 Laurence Fishburne 配音）的病毒就这样来到了弗兰克的体内。同样是在这里，存在着一只名为奥兹（克里斯·洛克 Chris Rock 配音）的白血球，这是一只特立独行的白血球，它并不满足于平庸的日常，而是想要活出精彩，活出新意。
