Muv-Luv ATE全名为《Muv-Luv Alternative Total eclipse 》，全集动画片改编自《Muv-Luv Alternative》的外传小说。故事的时间设定在西元2001年，由于人类遭到地球外起源种(联合国称其为BETA)的侵略，正面临灭亡的危机，因此人类开始了先进战术机技术开发计划“XFJ计划”，各个国家均派遣了专门人员参与其中，该作讲述的就是这些被派遣过来的人员之间的故事。（有虫子吃掉妹纸情节,反差极大,请谨慎观看.）
童年时一次看电视转播的经历，在少年日向翔阳（村濑步 配音）的心中种下了排球的种子。他在初中时代是排球部的主将，可是人丁寥落的排球部始终没有起色，唯一一场比赛也以惨败告终。在此之后，他终于如愿考入梦寐以求的学府乌野高中，并加入了该校的排球部。当年翔阳在电视上看到的正是乌野 高中的比赛，如今这个学校的排球却正面临着衰败的命运。与宿命的对手和好友影山飞雄（石川界人 配音）聚首于此，心怀排球梦想的少年们将团结一心，带领着乌野这名王者再度振翅高飞……
作为侯爵家的四子诞生的少年范恩自幼便被称为神童，备受期待。8岁时，他获得了被认为是毫无用处的「生产系魔术」。因此，他被父亲认为不配作为贵族，并遭到家族流放。因此，范恩被父亲认为不适合作为贵族，并被贴上失格的标签，随后被逐出家门。之后，范恩成为了一个无名边境村的领主，然而这个看似没用的生产系魔术，其实只要有材料就能生产任何东西，潜力惊人。在范恩的带领下，原本贫瘠的小村庄逐渐吸引各方人士，最终发展成为一座巨大的都市。
28 岁公司职员神城武，某天突然去世了，被神秘的青年转生到某个星球，剑与魔法的世界“马德乌斯”。开始新人生的他，拥有许多强大的能力，包括身体能力的强化、惊人的魔力，以及能够发现有价值物品的“探测能力”——利用这些作弊级别的力量，神城武开始了低调的旅行。主人公虽然最强，但并未意识到自己最强。这不是一个可爱女孩频繁出现的故事。没有后宫。完全没有恋爱元素。与个性十足的伙伴们一起，一边采集素材一边继续旅行的青年在异世界的生活。
咲良歌，喜爱唱歌的初二女生，有一天与正在寻找传说中的救世主“偶像Q娃”的妖精噗哩伦相遇，噗哩伦的家乡闪亮乐园，被チョッキリ团的BOSSダークイーネ化为黑暗，并将黑手伸到了镇上。“用我的歌让大家闪闪发亮”在这样的决意下，歌变身成传说中的救世主Cure Idol。唱歌跳舞粉丝服务，无论什么黑暗都变得闪闪发亮
刻苦学习的高中3年生·唯我成幸，为了获得免除大学学费的“特别VIP推荐”资格，而要去担任为备考而苦战的同级生们的教育指导员。教导的对象是“文学之森的睡美人”古桥文乃和“机关精巧的拇指姑娘”绪方理珠这两位学园顶尖的天才美少女！原本以为她们的学习能力完美无缺，没想到对于不擅长的学科却完全无能……！？成幸一边被充满个性的“学不来女孩”们玩弄于股掌之间，一边为了让她们努力通过大学考试！无论学习还是恋爱都“学不来”的天才们的恋爱喜剧，就此开幕！！
在一栋大楼最底层甦醒的13岁少女，瑞吉儿·加德纳(レイチェル・ガードナー)，她没有任何记忆，不知道自己为何在这里，而为了回到地面，她开始试着逃出去，但是突然在她面前出现了脸上缠满绷带、拿着有如死神般的镰刀的杀人鬼。“拜托你，杀了我。”“帮我一起从这里出去吧。那样的话，我就会杀了你。”两人之间的奇妙羁绊，随着那“荒诞的约定”而逐渐加深。这里究竟是什么地方？两人为何被囚禁于此？等待着两人的命运又是如何？为了从密闭大楼逃出的抱死觉悟之行揭开了序幕。两人最终是否能够坚守约定，并且安全地逃出这栋大楼呢？
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忍者并不存在。 ...这就是我们的想法。即使忍者存在，他们也绝不会向我们展示自己的外貌。这就是为什么忍者不“正式”存在。主角卡场和时是一个普通的男孩，他和我们其他人一样相信忍者不存在。他被许诺过正常、快乐和光明的日子……至少他是这么想的。有一天，一时的生命受到威胁，他听说这是一名身穿盔甲的忍者所为。一时的性命为何成为攻击目标？那是因为……他是十九代忍者的合法继承者！伊卡和科卡多年来一直存在冲突，科卡试图入侵伊卡。为了让一时活下去……他别无选择，只能自己成为忍者！就这样，他沉浸在无人知晓的忍者世界中。学习、战斗、面对困难，成为一名成熟的忍者。然而，这只是一时残酷命运的开始……
因为喜欢上了完美的风纪委员学姐水鸟亚鸟，本性是好孩子的优谷优故意打扮成了不良少女的模样。然而，天生不会装不良的优被亚鸟当成了可爱的小狗。
2014年，讨厌机械的高中生·夏目亮为了改变自己而迈出了那一步。然而，他却死于卡车之下——。然后2030年的东京港湾，潜入了未知兵器“EX-ARM”的交易现场的警察·上园美波与人造人·阿尔玛这一搭档遭到了装备着“EX-ARM”No.08的敌人的袭击。她们为了打破这一绝境，强制启动了从敌人手中夺走的“EX-ARM”No.00……
主人公汐崎春乃是一名住在父母经营的“NIWA旅店”的高中二年级学生，每天骑着本田生产的轻便摩托车去上学。春乃并非对周围的人和生活环境有所不满，但是心中却有一个朦朦胧胧的理想，那就是想去大都市看一看，想做一点什么特别的事情。后来，春乃在旅店里认识了骑着“LITTLECUB”的镝木小夜和骑着“BENLY”的别所杏里等朋友，然后向前迈出了新的一步…
无论发生什么都不会表露在脸上的女中学生·柏田，和表情丰富的同班同学太田君。正相反的两个人，一定会两情相悦？柏田和太田君，以及同学们温馨的恋爱喜剧。
